Оренбургская духовная семинария заключила договоры с учебными учреждениями Учебного комитета Русской Православной Церкви и Министерства науки и высшего образования Российской Федерации:
Религиозная организация — духовная образовательная организация высшего образования Русской Православной Церкви «Общецерковная аспирантура и докторантура им. святых равноапостольных Кирилла и Мефодия» (г. Москва) (договор от 13 сентября 2022 года).
Православная религиозная организация Русской Православной Церкви (Московский Патриархат) Синодальная библиотека Московского Патриархата имени Святейшего Патриарха Алексия II (г. Москва) (договор от 1 июня 2022 года)
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Оренбургский государственный педагогический университет» (г. Оренбург) (договор от 31 марта 2022 года)
Религиозная организация – духовная образовательная организация высшего образования «Казанская православная духовная семинария Казанской епархии Русской Православной Церкви» (г. Казань) (договор от 21 сентября 2023 года)
Религиозная организация — духовная образовательная организация высшего образования «Самарская духовная семинария Самарской Епархии Русской Православной Церкви» (г. Самара) (договор от 31 января 2022 года)
Религиозная организация — духовная образовательная организация высшего образования «Саратовская православная духовная семинария Саратовской Епархии Русской Православной Церкви» (г. Саратов) (договор от 24 января 2022 года)